Struktur organisasi MTsN Kota Cimahi disusun untuk mendukung pelaksanaan tugas akademik, kesiswaan, sarana, dan layanan administrasi madrasah.
| Jabatan | Nama |
|---|---|
| Kepala Madrasah | Rubaitun, S.Pd., M.Pd. |
| Wakil Kepala Bidang Kurikulum | Ayi Dindin Sahidin, S.Ag. |
| Wakil Kepala Bidang Kesiswaan | Ade Pawaz, S.Pd.I. |
| Kepala Tata Usaha | Sri Febiarti |
| Guru Bimbingan dan Konseling | Mila Sari |
Setiap wakil kepala madrasah membawahi koordinator bidang, wali kelas, serta guru dan tenaga kependidikan sesuai tugas masing-masing.